El CD Castellón aborda la incorporación de Giovanni Zarfino en el mercado invernal, según apunta El Periódico del Mediterráneo. El experimentado centrocampista uruguayo lleva un largo tiempo sin competir.
En verano de 2017 llegó a España para jugar en el Extremadura U. D. del grupo IV de la Segunda División B. Al término de la temporada lograría el ascenso con el conjunto extremeño a la Segunda División, participando en 31 partidos en los que anotaría 3 goles. Durante las temporadas 2018-19 y 2019-20 se convirtió en un fijo en la medular del Extremadura U. D. en la categoría de plata, disputando 66 partidos en los que anotó 9 goles.
El 10 de septiembre de 2020 el equipo extremeño lo cedió al C. D. Tenerife de la Segunda División durante una temporada. El 31 de agosto de 2021 rescindió su contrato con el Extremadura U. D. y firmó por la A. D. Alcorcón.
El 8 de julio de 2022, tras haber quedado libre, se comprometió con el Real Sporting de Gijón para las siguientes dos temporadas. Tras un inicio de temporada en el que fue titular habitual con el conjunto gijonés durante toda la primera vuelta, sufrió una lesión muscular en el partido disputado en El Molinón frente al C. D. Tenerife el 25 de febrero, por lo que desde entonces no disputó ningún partido más hasta el final de temporada. Tras dos años marcados por las lesiones, en verano de 2024 finaliza contrato con el club asturiano, quedando libre.