Eibar y Osasuna mantienen conversaciones por Javi Martínez, según apunta Diario de NAvarra. Según esta misma fuente, Racing de Ferrol y el Huesca, donde estuvo temporada y media, también han mostrado interés pero el conjunto vasco ha tomado la delantera con su propuesta. A Javi Martínez le queda otro año de contrato en Osasuna.
Nacido en Ólvega, Soria, Castilla y León, Martínez se formó en la cantera del CA Osasuna. El 2 de noviembre de 2016, con solo 16 años, hizo su debut con el Osasuna Promesas de Segunda División B, en la derrota en casa por 1-2 ante el Racing de Ferrol.
El 8 de septiembre de 2017, Martínez prorrogó su contrato hasta 2022. Marcó su primer gol en Segunda División B nueve días después, anotando el primero de su equipo en el empate 2-2 ante el CD Lealtad.
El 31 de mayo de 2019, Martínez hizo su debut profesional con el primer equipo del Club Atlético Osasuna en Segunda División, en una victoria por 3-2 sobre el Córdoba CF.
El 19 de diciembre de 2020 debutó en Primera División, en un encuentro frente al Villarreal CF en el que acabaría con derrota por un gol a tres, donde jugaría apenas un minuto de encuentro. Unos meses más tarde, el 24 de abril de 2021, anotó su primer tanto en un triunfo por 3 a 1 ante el Valencia CF.
El 1 de septiembre de 2022, firma por el Albacete Balompié de la Segunda División de España, cedido por CA Osasuna para disputar la temporada 2022-23.
El 31 de enero de 2023, se hace oficial la cesión a la S. D. Huesca, tras romper su anterior cesión al Albacete Balompié.
El 23 de agosto de 2023, vuelve a ser cedido a la S. D. Huesca de la Segunda División de España, para disputar la temporada 2023-24.